「马祖常见的传统建筑可概分为两个时期，早期居民多由福建的连江、长乐等地迁徙至此，所沿袭的建筑多以闽东式封火山墙建筑为主。包括颜色鲜明、形状夸张的庙宇火形封火山墙建筑，以及比较协和朴素的民居水形封火山墙建筑。
「芹壁，号称「马祖地中海」，旧名「镜港」，又称「镜澳」。名称源自于村落澳口前有一突起的岩礁，因状似一只大海龟，居民称它为「芹囝」，岩礁的四周海水清澈见底如镜，因而称为「镜港」。由海面往陆地望去，村落好似镶嵌于「芹囝」后方山壁上，故有「芹壁」之称。
福正聚落曾经是东莒最繁华的村落，但因渔获量递减，人口外移，独留一幢幢的石屋与后方东犬灯塔相伴，东犬灯塔由英国人设计建造，塔身趋于直筒状，入口为中国拱式门卷，墙身开设方形窗，塔顶与塔身间的修护平台，以挑檐石层层挑出，再用石灰浆抹出装饰性的线脚。福正聚落的建筑形式，多为简单的二落水，乱石砌，与芹壁相比，又是另一种質樸的氛围。
北海坑道位处铁板海岸线，有可供百余艘登陆小艇使用的地底坑道，当年被视为高难度的工程，工程艰巨、气势壮阔，堪称鬼斧神之作。在过去战争频发的年代，北海坑道曾试图扮演着地下码头的运补功能；今日当人们走进深邃的坑道中，一幕幕雄伟壮阔的岩壁、幽暗浮动的倒影，都让游客不自觉地发出阵阵赞叹。